孕早期肚子隐隐作痛的原因主要有以下几点：

一、可能是受精卵刚刚着床时出现的子宫反应。

二、胚胎在宫内生长发育时，子宫也会出现相应增大的表现，孕妇会感觉小腹胀痛。

三、部分女性在孕早期时由于激素的影响出现的便秘引起，排便后隐痛就会消失。

四、与怀孕无关的疾病导致，例如卵巢肿瘤、子宫肌瘤等。

五、与怀孕有关的疾病，如宫外孕、葡萄胎、流产等。

因此，孕早期出现肚子隐隐作痛是常见症状，建议在医生的指导下进行系列检查后再做最终判断。如果发现为异常情况，需要及时处理。