早上起来脚掌疼，可能与以下因素有关：

1.在白天时运动时间过久，或者是进行重体力劳动，在第二天早晨就会出现脚底疼痛的症状。主要表现为酸痛，可通过热敷、温水泡脚、按摩等方式予以改善，通常在1~2天内会恢复正常。

2.如果本身患有足底筋膜炎没有完全康复，在晚上睡觉时脚掌部位受到冷风刺激，可能会使炎性物质增多，在早晨起来就会出现脚掌疼痛。应当使用抗炎镇痛类以及活血化瘀的药物予以治疗。

3.早上起来脚掌疼痛，还可能为足底骨关节炎、足底骨质增生等因素所导致。