尿道囊肿是由于尿道腺体管堵塞，分泌物无法及时排出，形成囊肿。

尿道囊肿分为先天性和后天性的因素，先天性的尿道囊肿是由于遗传的基因异常造成腺管发育不全，局部的尿道细胞发育不正常，最终造成尿道旁腺的管口出现封闭，分泌物不能排出形成囊肿。

后天的因素都是因为尿路感染引起，由于炎症的反复刺激造成尿道的旁腺黏膜增生，最终形成囊肿。如果出现小便异常伴疼痛，需要给予积极治疗，防止出现严重的并发症。