耳后根疼痛考虑皮下组织炎症、局部受到创伤、外耳道炎症、急性乳突炎、咽喉方面的疾病等因素引起。

当耳后的皮肤组织发生炎症感染时，会引起耳后根发生炎症性的反应导致疼痛，局部会出现红肿。受到外伤，例如外力的碰撞，导致皮下的软组织受损，可导致出现疼痛感，伴有瘀血的现象。

外耳道炎症、急性乳突炎也可导致耳后乳突部位出现红肿、疼痛，通常会伴有耳道流脓的症状。咽喉方面的疾病，例如急性咽喉炎、扁桃体炎，也可引起耳后出现放射性的疼痛。