HPV病毒的分型目前有130多个，根据其是否能导致癌变，大体分为两大类，即高危型和低危型。

高危型HPV病毒导致癌变的机会高，现在临床上比较多见的有14种，主要包括HPV5、8、14、17、20、36、38、16、18、30、31、33、35、39，这些病毒与宫颈癌、外阴癌、直肠癌、阴茎癌、口腔癌、肛门癌、前列腺癌、扁桃体癌、膀胱癌等发病有关系。

低危型的HPV感染，如HPV1、2、3、4、7、10、12、15、6，11、13、32、34、40、42、43、44、53、54等，它们与寻常疣、扁平疣等疾病相关。