大便的时候屁眼如果有疼痛：

首先考虑有肛裂的存在，就是在肛管直肠皮肤的位置形成了裂口，在粪便的刺激下会出现刀割样或者是撕裂样的疼痛。

另外内痔如果发生了脱出，在回纳不及时的情况下，受到粪便的刺激也可以产生疼痛，或者是外痔有水肿、血栓、发炎的情况下，大便的时候屁眼也会有疼痛的症状。

再者，就是肛门周围有感染性的疾病，比如有肛门周围的脓肿或者是直肠黏膜下的脓肿，在下蹲排便的过程当中也会产生屁眼局部的疼痛。

可以先到正规医疗机构的肛肠科进行检查，一般通过肛门局部的望诊、肛门镜的检查或者是肛门的指检就可以初步明确诊断，主要的治疗方法是药物治疗或者是通过手术治疗。