巧克力囊肿一般是指子宫内膜异位到卵巢而形成卵巢巧克力囊肿。这个病不能够自愈的，巧克力囊肿一般会引发痛经。并且出现痛经逐渐加重趋势，严重有的患者影响生育，出现卵巢不排卵。

所以，有卵巢巧克力囊肿的患者，治疗方法只能是通过手术，术后选择相应的药物、防止复发，来对症调理。

巧克力囊肿影响生育，一般手术后容易出现再次复发这样的情况。所以，生育年龄妇女有巧克力囊肿，一定到医院积极治疗，这种情况自己好转可能性不大，除非是绝经了。