高烧39℃反复发作，考虑与感染性疾病、自身免疫性疾病或其他因素有关。

高烧是指腋下体温超过38.5℃，如果高烧反复发作，主要考虑与感染性因素有关，比如病毒感染、细菌感染，致病菌作用于人体，导致体温调定点上移。如果不能及时清除体内的致病菌，会导致患者反复发热。

排除以上因素以后，考虑与非感染性疾病有关，比如动脉炎、系统性红斑狼疮等自身免疫性疾病，可能导致患者反复高热。除此以外，肿瘤性疾病，比如血液系统肿瘤，服用某些药物后引起了过敏反应，也可能导致患者反复发热。