丙型肝炎和乙型肝炎最大的区别是机体所感染的病原体不同，丙型肝炎感染的是丙肝病毒，乙型肝炎感染的是乙肝病毒，但是两者在临床上又有一定的类似性，主要表现为它们的临床症状多为常见的肝炎症状，如乏力、纳差、尿黄等，如果病情没有及时控制，两者最终都有可能进展为肝硬化、肝癌。

两者抗病毒治疗方案有一定的区别：

首先，丙肝病毒和乙肝病毒都可以用干扰素治疗，但是丙肝病毒还需要配合利巴韦林。

其次，丙肝患者可以口服的抗病毒药物为DAAS药物，而乙肝患者口服的抗病毒药物为核苷类似物。