凌晨咳嗽剧烈可由以下原因引起：

1.可能是夜间睡觉的时候受凉遭受风寒，诱发出现呼吸道感染，尤其是上呼吸道感染。出现这种疾病，可导致出现剧烈咳嗽、嗓子疼、流鼻涕、头晕，甚至发热等相关表现，临床上比较好发于儿童以及体弱的老年人。

2.可能与胃食管反流有关。夜间平躺后非常容易出现肌肉松弛，出现胃食管反流刺激咽喉部可以诱发患者出现咽喉部呛咳、咳嗽等表现。这种情况，临床上大多数伴有烧心、嗳气等症状。

3.有可能与既往肺内感染、肺脓肿、支气管扩张、支气管哮喘等疾病有关，夜间的时候容易出现迷走神经兴奋，诱发出现剧烈咳嗽，尤其是分泌物堆积在肺内气管内没有出来的时候，可能会更加敏感。