严重营养不良是由于饥饿、禁食，饮食结构不合理、胃肠道吸收不良、营养匮乏或慢性消化道疾病引起的闭经。对于严重营养不良引起的闭经，首先要去除病因，治疗营养不良疾病，改善营养和提高健康素质。

有胃肠道疾病或者慢性消化性疾病积极进行治疗，首先要恢复正常的饮食结构，营养均衡，既要保证蛋白质、脂肪和糖类的摄入，还要补充维生素和矿物质。

根据个体化的原则制定合适的营养补充方案，使体重恢复到标准体重之内，同时可以给予雌孕激素周期治疗或者是促排卵治疗，来恢复月经。