同房后肛门疼痛比较常见的原因，有以下几种情况：

1.有肛裂的存在。由于肛裂的裂口比较深。肛门括约肌外露在进行同房的过程当中，刺激到肛门周围的括约肌产生痉挛，继而会出现同房后的肛门疼痛。

2.有痔疮的存在。特别是在同房的过程当中，导致了内痔部分发生了脱出，或者是已有的外痔出现了水肿、血栓的情况，可以在同房以后出现肛门疼痛的情况。

3.有一些感染性质的疾病存在。比如有肛管直肠周围间隙的脓肿，或者是直肠黏膜下的脓肿，在同房时局部组织有充血，并且受到外来压力的刺激，会出现肛门的疼痛。