急性化脓性甲状腺炎是甲状腺的非特异性的感染。这种疾病多是因为感染所引起的，感染常常是因为血行或者是淋巴或者是临近组织器官蔓延而来。也有医源性的，比如像甲状腺内给药，或者是甲状腺穿刺，拔牙或者是直接创伤等以后引起的。

目前已经报道的致病菌有金黄色葡萄球菌、链球菌、肺炎球菌、大肠杆菌、分支杆菌、不动杆菌等，混合厌氧菌也有不少见的，像假丝酵母菌、布鲁氏菌、寄生虫等等。