宝宝睡着后咳嗽厉害，常见的原因主要包括食物残留、胃食管反流、吸入刺激性气体、疾病等。

1.食物残留。宝宝临睡前如果口中含有食物，睡着后可能会导致食物残渣呛入气道引起阵发性呛咳。

2.胃食管反流。宝宝消化系统功能发育不完善，可能会导致夜间出现胃食管反流，造成呼吸道黏膜刺激性咳嗽。

3.吸入刺激性气体。如果家长在宝宝的卧室使用蚊香、喷洒空气清新剂等，宝宝睡着后可能因刺激性气体吸入导致气道过敏引起咳嗽。

4.疾病。宝宝如果本身患有肺炎等呼吸系统疾病，睡着后可能由于空气干燥导致气道分泌物黏稠引起咳嗽加重。