更年期卵巢囊肿可以采用手术切除的方法进行治疗。更年期女性患有卵巢囊肿的几率相对比较低，一旦确诊患病，应根据卵巢囊肿的性质以及生长部位、大小决定治疗方法。

如果卵巢囊肿属于良性，并且囊肿比较小，患者可以无需治疗，但需要在生活中注意做好护理，避免吃过于油腻的食物，保持良好的情绪，预防卵巢囊肿的增大。

对于恶性卵巢囊肿，应尽量以手术切除治疗为主。由于更年期的女性卵巢功能已经衰退，因此在治疗上可以采用输卵管卵巢切除术为主，从而达到治愈的目的。