怀孕12周有褐色分泌物，要尽快到医院就诊，这种情况下说明有阴道出血的情况。

到医院正规就诊，医务人员会根据阴道分泌物的量来选择合适的检查和治疗方式。常规会做产科彩超的检查，查看胎儿的情况，查看宫颈管的长度，会谨慎小心的消毒外阴之后，做阴道窥阴器探查阴道的检查。

如果宫颈上有严重的糜烂或者有赘生物，也会出现褐色分泌物的情况，明确褐色分泌物的原因，再选择合适的治疗方式。如果检查过后宫颈上没有任何异常，就考虑是宫腔内的出血，这个时候常规给予保胎治疗，建议孕妇卧床1~2周，卧床期间口服一些中成药，药物保胎治疗。