功能性大便失禁的晚期症状是肛门完全失禁。功能性大便失禁可引起大便和气体以及肠分泌物不受控制，自肛门随意排出。尤其在咳嗽、喷嚏、劳动时更加明显。

患者的日常生活和劳动带来极大不便，导致患者焦虑、易怒、失眠、不合群、孤僻等情绪波动。

因为肛门失禁引起胃肠功能紊乱，导致患者消化功能减弱，激发消化不良、贫血、消瘦，患者免疫力和抵抗力下降，内分泌和代谢功能紊乱、水电解质紊乱、酸碱平衡失调引起多起器官功能衰竭，严重时可危及患者生命。