连续熬夜两天对精子影响一般并不大，但是尽量避免长期熬夜，必要的时候需要进行就医治疗。

偶尔熬夜两天并不会对生物钟产生影响，也不会影响到内分泌的紊乱，对于精子的质量也不会产生太大的影响。但如果长期熬夜，很有可能会对身体的器官以及功能产生影响，使睾丸产生精子的能力下降，降低精子的活力，严重的可能会出现弱精症或者少精症。

如果出现了弱精症，一般可以采取激素治疗，比如促性腺激素或者是抗雄激素治疗，也可以通过使用胰肌肽原酶或者是七叶皂苷类药物进行治疗，能够改善睾丸的血液循环，促进生精能力。

如果出现了少精症，可以服用天然维生素E或者是谷胱甘肽等药物，能够起到抗氧化的效果，提高精子的浓度与活力。