胚胎发育不良的原因，常见于染色体异常、女性激素水平异常、男方精液异常，或者是在怀孕期间过多地接触了化学性的物品、放射线等。

也可能为药物因素所引起，在怀孕期间由于孕妇生病，应用了某些药物，可能会导致胚胎发育不良。另外，严重营养不足、排斥免疫反应、孕妇自身疾病以及怀孕早期感染等，都可引起胚胎发育不良。

一旦检查出胚胎发育不良，建议先进行胚胎DNA检查，必要时可适当应用药物干预治疗，尽力挽救胎儿发育不良的情况；同时，孕妇应注意多卧床休息，多补充叶酸，保持心情舒畅。