脑出血微创手术以后有可能会有一些后遗症的发生，最常见的就是一些神经功能障碍的后遗症。假如抽血的部位损伤运动功能中枢，这种情况下手术以后就可能会导致手脚偏瘫或者是活动障碍的后遗症。

有些出血压迫、刺激了语言中枢，手术以后即使好了也有可能会导致语言功能障碍的后遗症。还有一些出血的部位压迫了感觉中枢，就可能会导致手术以后出现躯体或者是手脚感觉障碍的后遗症。

还有一些患者位于脑干这些重要的部位，手术以后有可能患者会长期不得清醒，出现植物生存甚至是高度残疾等后遗症，有些会有癫痫发作的后遗症。