脑真菌性肉芽肿可以发生于任何年龄，但大部分的病例发生在30到50岁之间。男性患者多于女性。本病起病缓慢或亚急性。如新型隐球菌与曲霉菌脑内感染都原发于上呼吸道粘膜和肺经血行播散。大多数原发病变症状尚不明显时，就可以出现神经系统症状。患者一般都有低热，偶有高热。首发症状多为头痛、恶心呕吐、颈项僵直等脑膜刺激症。病程数周至半年，偶有超过一年者，少数病人有缓解和复发。真菌性的肉牙肿属于深部的真菌感染，凡是能引起深部组织感染的真菌都可以是本病的致病菌。