肝内胆管结石和肝外胆管结石的主要区别是胆管的部位不同，一般由左右胆管为分界点，以上的部位是肝内胆管产生的结石。左右肝管以下部位，包括胆总管里面结石或者肝总管里面的结石，都叫做肝外胆管结石。

还要注意，肝外胆管结石是因为结石堵塞主要胆管之后，造成胆汁流动性明显异常，就会产生疼痛症状，还会出现黄疸、高热、寒战等表现。

但是肝内胆管结石，结石堵塞的不是全部的胆汁，只能影响肝脏某一个区域的胆汁流动性。所以两种疾病有明显区别。