亚临床甲状腺功能减退症的患者，在饮食上主要是根据病因的不同而有所禁忌。如果亚临床甲减的病因是桥本甲状腺炎,这种患者要忌碘饮食或者限碘饮食。因为过量含碘的食物或者药物，会使亚临床甲状腺功能减退状态发展成临床甲减的状态，所以针对这种患者，要忌碘或者限碘饮食。

除此以外，甲减的患者还常常容易引起高胆固醇血症，所以如果亚临床甲减的患者，同时合并了有高胆固醇血症。一般要建议限制富含胆固醇食物的摄入，主要包括有动物内脏、蛋黄等这些食物。