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肛管癌的真正病因是乳头状瘤病毒的感染,在乳头状瘤的亚型中,HPV16的阳性率导致的肛管癌达一半以上。
患者的免疫功能与肛管癌发生有明显关系,由于机体的免疫系统受到抑制,艾滋病患者的肛管癌发病率明显增加。
肛门周围慢性疾病,如肛瘘及瘢痕组织恶变,慢性炎症性肠病也可导致肛管癌,其他病因还有单纯疱疹病毒感染、乙肝病毒、放射线损害、吸烟、同性恋有肛交史的男性。
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