H5N1禽流感可以用抗病毒药物以及支持对症处理的药物治疗。

当发生H5N1禽流感时，通常需要早期及时的使用抗病毒药物治疗，此时要求尽早的使用，一般在48小时内使用效果会更好一些。临床上多可以选择奥司他韦、扎那米韦、帕那米韦、阿比多尔等。当然还可以联合一些中医中药的治疗，例如连花清瘟胶囊或中药的汤剂。

对大多数轻症患者通过上述抗病毒药物、配合对症处理，疾病多能较快的痊愈。当然，还可以根据情况使用止咳、退热等药物。如果禽流感合并细菌或真菌的混合感染时，特别是那些重症患者，还需要早期使用相应的抗感染药物。部分危重症的患者还可以酌情使用短程适量的糖皮质激素，来减轻肺部的炎症反应，改善患者病情。