长期戴美瞳一般不会导致黑眼珠变小。

黑眼珠最表面的一层结构是角膜组织，佩戴美瞳的时候会直接和角膜接触。如果长期佩戴美瞳之后，发现自己的黑眼珠好像变小，可能需要考虑角膜缘组织出现结膜样的改变，或者是局部出现浑浊从而变白，这样从外观上看就感觉角膜的黑眼珠变小。

所以，这个时候应当停止继续佩戴美瞳，同时及时前往医院检查，看是否出现角膜上皮的病变。一旦发生角膜病变需要及时用药治疗，避免出现角膜病变进一步加重。