检查短头畸形的方法如下：

第一，通过患儿的体格检查进行判断。短头畸形患儿的额头部位颅骨呈扁平高耸状态，额头与枕部没有正常的突出，略向后倾斜。

第二，通过影像学检查进行判断。短头畸形患儿的颅骨X线检查显示颅骨缝消失，两侧的冠状缝呈现钙质沉着影像，颅脑CT检查或者核磁共振检查结果均显示明显的脑室变小征象。因此，通过上述检查方法就能够检查出小儿短头畸形。

建议家长要及时地带宝宝住院治疗，由医生根据病情制定合理的治疗方案，尽早改善患儿症状。