桥本氏甲状腺炎主要是一种与免疫相关性疾病，用药禁忌含碘的药物，因为桥本氏甲状腺炎容易合并甲状腺功能减低，所以抗甲状腺药物要慎用。桥本甲状腺炎的用药取决于患者的病程时期，一般很多桥本甲状腺炎的患者早期没有特别的临床症状，仅仅会有甲状腺轻度的肿大不需要用任何药物处理。当桥本氏甲状腺炎的患者出现甲状腺功能亢进症或者甲状腺功能减退症的时候，一般在甲亢这个时期，很少用大剂量的抗甲状腺药物，而在甲减的时候则需要适当应用甲状腺激素替代治疗。