两边脸颊长黑色素的原因如下：

1.如果不注意面部保养和保护，长时间日晒可能会造成晒伤，导致表皮内酪氨酸酶活性增加，促进黑色素合成使两边脸颊长黑色素。这种情况是由于表皮黑色素细胞受损导致，如果注意保护，积极调养，大多数可以恢复。

2.如果女性内分泌失调，体内代谢紊乱，使黑色素代谢缓慢，沉积于两边脸颊处导致。这种情况出现的黑色素调理起来比较缓慢，在内分泌平衡后症状才能得到缓慢改善。

3.有些女性是由于遗传因素导致的两边脸颊上长黑色素，这种情况如果想消除比较困难。