新冠疫苗三针与两针的区别，主要在于技术路线，也就是种类的不同。新冠疫苗三针属于重组蛋白疫苗，而两针的属于灭活疫苗。

此外，二者的接种时间也是不同的，新冠疫苗三针要求在6个月之内完成接种，而新冠疫苗两针第两针要在8周之内尽快完成。但是，不管接种的是新冠疫苗三针还是两针，其有效性和安全性都是非常可靠的，无需太过担心，接种之后的效果并没有什么区别。

但是，需要注意最好按照临床推荐的免疫程序，在规定时间内完成接种，以免引起免疫效果不好，保护率下降的情况。