打完退烧针还高烧39℃，可能是药物还没有发挥作用，没有解除病因。

打完退烧针后，腋下体温还达到39℃，考虑于身体对注射的针剂反应不太敏感，或针剂注射的时间比较短、药物还没有充分发挥作用有关。建议多喝水，配合温水擦浴，给予退热药物，比如布洛芬，有利于体温下降。

除此以外，病毒感染、细菌感染，也会导致机体体温升高。通过单纯给予退热针剂，不能解除发热的原因，注射退烧针后，体温还会再次升高。

建议进行血常规检查，了解引起发热的原因，可以针对病因给予抗感染、抗病毒的药物。比如头孢菌素、左氧氟沙星、抗病毒口服液等药物治疗。