附睾囊肿不能盲目治疗。如果由于附睾炎引起，建议在医师指导下服用喹诺酮类抗生素，或者头孢类抗生素消炎处理，然后用毛巾热敷睾丸，促进炎症吸收。

如果做尿常规检查和精液常规检查，排除睾丸炎的可能性。应当在医师指导下，服用活血化瘀、排脓、消肿类中药或者中成药治疗附睾囊肿。如果服药治疗效果不佳，建议选择微创手术将囊肿切除，或者应用引流的方法将囊肿引流出来。

附睾囊肿康复治疗期间，应避免压迫囊肿，避免同房、手淫，否则会使附睾内压升高，影响附睾囊肿康复。生活中患者禁忌辛辣、刺激的食物，禁忌饮酒。