引起咳嗽伴有呼吸困难的原因，主要有以下几个方面：

首先，考虑是呼吸道感染引起，包括支气管炎、肺炎、支气管扩张、慢阻肺病等常见的呼吸道疾病。

其次，考虑也可能是心功能不全引起，比如感染、劳累诱发的急性左心衰竭，也有可能会出现咳嗽、呼吸困难的症状。

最后，也可能是由化脓性扁桃体炎，严重的咽喉炎导致，同时还可能会伴有咽部肿痛，查体可见增生的淋巴滤泡。

建议这种情况，最好去当地医院的呼吸科完善心电图、心脏彩超、胸部CT、血常规、痰培养、肺功能等相关检查，明确诊断以后，再选择合适的药物进行治疗。