慢性甲状腺炎不会自愈。慢性甲状腺炎可能会成为终身的疾病，需要终身服用相关的药物进行对症治疗。

如果慢性甲状腺炎的患者，出现了甲状腺功能亢进症的临床表现时，需要使用β受体阻滞剂、甲巯咪唑等药物来进行处理。如果出现了甲状腺功能减退症的临床表现时，则需要服用左甲状腺素钠片等药物来对症治疗，并且应在专科医生的指导下进行药物的调整。对于较严重的慢性甲状腺炎，必要时可以使用糖皮质激素来控制炎症。

慢性甲状腺炎的常见的临床表现有眼球外突，患者的角膜暴露在外面，容易引起炎症，并且出现眼干、眼涩等症状，严重的患者眼睛不能正常闭合等，需要对慢性甲状腺炎引起重视。