扁桃体化脓一般是吃抗生素药物。扁桃体化脓多数情况下都是因为细菌感染引起的，可口服抗生素药物治疗。首选药物是青霉素类抗生素药物，例如阿莫西林克拉维酸钾片，消炎作用比较明显，也可以选择头孢类抗生素药物，例如头孢丙烯。

但如果对头孢或青霉素过敏，也可以选择阿奇霉素。必要时做分泌物培养以及药敏试验，选择敏感抗生素药物治疗。

另外，扁桃体化脓很容易会导致出现发热、疼痛等症状，可口服非甾体类的抗炎药物，例如布洛芬缓释胶囊。