治疗内分泌紊乱的药物，主要是激素替代药物和抑制激素分泌的药物，需要根据病因的不同去选择。因为内分泌失调的疾病有很多，包括下丘脑疾病、垂体疾病、甲状腺疾病、甲状旁腺疾病，肾上腺的疾病以及性腺疾病。

不同的内分泌腺体器官出现的问题，选择的药物不同。比如，如果出现了甲状腺功能亢进症，需要选择甲巯咪唑，或者是丙硫氧嘧啶治疗。如果是甲状旁腺功能减退症，需要选择钙剂以及维生素D进行治疗。如果是原发性醛固酮增多症，需要选择螺内酯进行治疗。如果是垂体的泌乳素瘤，需要选择溴隐亭进行治疗。