发烧时如果患者出现了一侧耳朵疼痛症状，建议先进行退烧治疗，同时查明病因后进行对因治疗。

如果退烧后患者耳朵疼痛症状随之消失，可以考虑是因为发烧影响到了人体内环境平衡，或者导致耳部神经敏感度升高，而引发的临床表现，一般问题并不大。

如果退烧后耳朵疼痛症状一直存在，需要考虑和中耳炎等耳部疾病有关。而发烧症状的出现也多是因为炎症刺激机体免疫系统引起，这种情况下需要按医嘱使用抗生素类药物进行对因治疗，期间可以配合止痛药进行对症治疗。