导致肩胛骨下方疼痛原因有很多种：

一、应考虑近期有没有肩部外伤，严重外伤后可能会导致肩胛骨骨折，在夜间气温下降时会出现骨折部位疼痛的情况。

二、腹腔脏器尤其时胆囊疾病，晚饭脂肪摄入过多，也会出现有右肩胛骨下方疼痛的情况，通常还伴随着右上腹部疼痛的情况。

三、如果是肩胛骨疼痛伴随着颈部酸痛的情况，还可能是因为颈椎病导致的肩胛骨下方疼痛。

如果反复出现有肩胛骨下方疼痛，最好到医院完善CT检查，明确诊断。