早上肚子疼，可能与晚上饮食不当有关。晚上吃一些不干净的食物会引起肠炎，早上起来会引起肚子疼，还可能伴有腹泻。

患有十二指肠溃疡，早上起床后由于空腹状态会出现肚子疼，早餐后疼痛可能会减轻，可能还会出现嗳气、便秘、腹泻、烧心等症状。

早上起床肚子疼伴有腰痛，可能是输尿管结石引起的，疼痛会很严重，通常会出现血尿以及尿频的症状，需要通过进行泌尿系统的B超检查进行确诊，能够对结石的位置以及大小进行判断，然后进行相应处理。

如果经常出现早晨肚子疼的情况，需要到医院进行就诊，明确诊断。