融合肾没有特效的治疗药物。融合肾是肾脏先天性畸形的一种类型，肾脏畸形后，会导致输尿管发生一定程度的变异，输尿管可能会出现不同程度的狭窄。对于解剖结构的异常表现，不需要口服药物治疗。但是融合肾导致的输尿管狭窄，会导致患者发生泌尿系感染、泌尿系结石、腹痛的症状，对于这些症状可以给予对症的药物治疗。

部分发生融合肾的患者没有明显的输尿管狭窄，患者也没有任何的症状，不需要任何的治疗。严重的输尿管狭窄，需要采用手术治疗的方法。