对于尿道结核主要是来源于泌尿系统最上端的肾脏，通过肾脏肾盂，播散到输尿管膀胱，然后进入到尿道，从而引起尿道结核，这是最主要的原因。而在一部分患者当中，即使肾结核达到治愈，那么有可能会由于潜在前列腺或者精囊当中的结核分支杆菌定植，一旦患者由于免疫能力低下，或者抵抗能力低下，都会导致前列腺结核和精囊结核死灰复燃，从而蔓延到后尿道、前尿道，导致整个尿道感染结核分枝杆菌，从而形成尿道结核。