引起射精疼痛不适的一些主要原因有：性生活过频、生殖器官的炎症，如精囊炎、前列腺炎、后尿道炎等，泌尿系结石、泌尿系统的肿瘤等。另外性生活时过于兴奋，动作强烈粗暴，也可以造成射精疼痛不适。

在临床上男性在性生活中感受多种原因的疼痛不适，包括包皮的刺痛，射精时腹股沟的绞痛，射精后的会阴部及腰骶部的疼痛，以及射精后排尿时尿道灼热疼痛等几种。射精疼痛主要是与生殖系统的感染密切相关，如前列腺炎、精囊炎等有关。

射精管出现结石、梗阻和先天性梗阻，也会造成射精疼痛不适。

前者可以通过控制感染缓解，后者需要手术治疗来缓解。生殖道感染、炎症、盆底肌肉、韧带充血、炎症都可能造成这种射精后的不适感。