肛瘘坐浴水进伤口没有事，因为坐浴水中一般放入具有消炎作用的高锰酸钾或清热燥湿、消肿止痛作用的中草药，对伤口的愈合有利。肛瘘手术后伤口一般为开放性伤口，有利于创面的炎性渗出。

患者在大便后伤口容易受到粪便的污染，术后肛门熏洗坐浴可以清洁伤口，减少伤口疼痛，有助于伤口的生长。坐浴液中放入药物，可以起到消炎等治疗作用。

坐浴还可以减轻术后疼痛，减轻肛门坠胀，缩短疗程。