肛门总有疼痛的感觉，和克罗恩疾病相关的可能性并不大。

克罗恩病是慢性的肠道炎症，以腹痛、腹泻、体重下降为主要的临床表现，病变的范围一般出现在回肠的末端和临近的结肠，很少病变到肛周。因此出现了肛门疼痛的感觉，需要首先考虑肛周的病变，例如痔疮、肛裂、肛周脓肿、直肠炎等。

其次，克罗恩病多属于慢性长期反复发作的疾病，如果肛门总有疼痛的感觉，往往和病程不太相符。建议可进一步的肛肠科门诊就诊，首先排除肛周的疾病。必要时肠镜检查。