肾病综合征预后的个体差异很大，取决于很多因素，微小病变型肾病和轻度系膜增生性肾小球肾炎的预后好，微小病变型肾病一部分患者可以自发缓解，治疗缓解率高，但缓解后容易复发。早期膜性肾病能有较高的治疗缓解率，晚期虽难以达到治疗缓解，但病情多数进展缓慢，发生肾衰竭比较晚。系膜毛细血管性肾小球肾炎，极重度系膜增生性肾小球肾炎治疗效果不好，预后很差，很快进入慢性肾衰竭。局灶阶段性肾小球硬化预后最主要的因素是尿蛋白程度和对治疗的反应，出现肾病综合征，存活率为50%，对激素治疗缓解的10年存活率达90%以上，没有效果的为40%。肾病综合征只能缓解，不能治愈。