汉坦病毒的核酸检测也称为基因检测，主要采用的是聚合酶链反应的技术，汉坦病毒的核酸检测有着方便、快速、高灵敏度等特点。

目前已经广泛的用于临床上对于汉坦病毒的检测和分型，汉坦病毒为一种分节段的单股负链的RNA病毒，汉坦病毒基因组的S片段比较保守，而M片段G1区在不同型中的差异比较大，可以根据S和M片段的核酸序列，分别设计各基因型特异性引物以及属特异性引物，能够用于汉坦病毒的分型和检测。

在临床上汉坦病毒的核酸检测对发病机制以及实验室诊断有着重要的意义。