肛周脓肿的症状和肛周脓肿位置的高低有一定的关系，按位置的高低分为高位肛周脓肿和低位肛周脓肿。低位肛周脓肿最主要的症状就是疼痛，这种疼痛会非常的剧烈，并且逐渐加重，很多会引起患者出现夜不能寐、食之无味等等。脓肿成熟的，会在局部触及波动感，只有在脓肿自行破溃后疼痛才会暂时缓解。而高位的肛周脓肿，由于位置偏高，并不在肛门周围，所以疼痛症状并不明显。主要的表现为肛门坠胀不适甚至会伴有里急后重便后不尽感等等，也会伴有全身症状，比如发热。