指甲上如果有真菌，一般可以根据真菌感染的严重程度对应处理。

如果只是有轻度的甲板形成感染，特别是甲板的游离缘出现真菌感染，可以适当外涂抗真菌类的药物，特别是外用的药膏或者药液就可以，比如可以选择阿莫罗酚软膏外涂，也可以外涂阿莫罗芬搽剂等。

有的人形成这种指甲的真菌感染，可以适当使用水杨酸软膏或者使用水杨酸酊来外涂治疗，这样也能够起到有效杀灭真菌的效果。如果整个手指甲的甲板都形成了真菌感染而造成灰指甲，可以通过口服抗真菌的药物方式治疗。