真菌寄生在人体正常组织内时，一般不会致病。

但当患者机体免疫力下降，长期大剂量使用广普抗生素引起菌群失调；或者长期使用糖皮质激素、受到电离辐射和使用免疫抑制剂，使机体免疫功能受损；或者患者有糖尿病，并且血糖控制差，发生酮症酸中毒时；也可在眼部外伤继发真菌感染时，可能导致真菌感染。

除上述情况以外还可因鼻窦真菌感染蔓延而来，其中筛窦和蝶窦真菌感染导致眼眶真菌感染较多。主要是注意休息，定期复查。