孕妇患有小三阳需要以下处理：

首先，在怀孕七个月左右时，予以口服替比夫定抗乙肝病毒治疗，使乙肝病毒血清滴度下降到比较低的水平，从而减少乙肝病毒的母婴传播。

其次，在胎儿分娩后第一时间内给胎儿注射乙肝疫苗和乙肝免疫球蛋白，也能够很大程度地阻断乙肝的母婴传播。

再次，孕妇本身在怀孕期间也要注意多复查肝功能。因为怀孕会导致乙肝病毒活动，从而引起乙肝肝炎。只有定期复查肝功能，才能够及时发现肝脏炎症，及时予以护肝降酶治疗。